•El museo, inaugurado el día 4 de Junio de 2002 con la presencia de S. M. el Rey D. Juan Carlos I, se encuentra en el Patio Herreriano, uno de los claustros del antiguo Monasterio de San Benito, que empezó a construirse en el siglo XIV.

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•El claustro es obra del arquitecto Juan Rivero Rada, y es un ejemplo de la arquitectura clasicista de la España. Además del edificio antiguo, perfectamente restaurado, el museo ocupa un edificio anexo de nueva planta. Ambos edificios enlazan en el exterior con la apertura de una nueva plaza ajardinada.

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•El museo se distribuye en once salas, ocho de las cuales corresponden al espacio del monasterio, destacando particularmente la Capilla de los Condes de Fuensaldaña. Las otras tres salas pertenecen al nuevo edificio. El museo se completa con una Biblioteca, un Centro de Documentación, sala de actos, taller pedagógico, seminario, librería-tienda, cafetería-restaurante, recepción, taller de restauración y almacenes de obras.